VIROLOGIAMAIGODDDD

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Os vírus:

O genoma viral em RNA(+) é por si só infeccioso.
Os genomas de vírus em DNA são os de maiores dimensões.
O genoma viral em RNA(-) não é infeccioso por si só.
Os genomas de vírus em RNA são os de maiores dimensões.
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As vias que permitem um vírus sair do endossoma tardio e ter acesso ao citoplasma da célula hospedeira são as seguintes: (escolha a opção correta)

Fusão, montagem e permeabilização
Budding, lise e formação de poro
Lise, permeabilização e fusão
Permeabilização, lise e budding

A saída de um vírus da célula hospedeira pode ocorrer por vários processos. Leia as frases e escolha as opções corretas.

Vírus não envelopados podem sair da célula por budding
Vírus não envelopados provocam a lise celular
Vírus envelopados podem sair da célula por formação de vesículas de exocitose
Vírus envelopados provocam sempre a lise celular
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Leia as seguintes frases e escolha a frase correta

Os vírus com genoma ssRNA(+) apresentam genomas segmentados
Vírus em RNA apresentam mutações pontuais por erros de replicação em número superior aos que são observados para vírus dsDNA.
Os vírus em RNA apresentam genomas de grandes dimensões
Vírus com genoma ssDNA são na sua maioria genomas ambisense

Leia as seguintes frases e escolha a frase correta:

O genoma de um vírus icosaédrico é sempre encapsidado numa cápside pré-formada (procapside).
A encapsidação do genoma viral ligada ao gasto de ATP ocorre para vírus com cápsides icosaédricas
A montagem da cápside, nos vírus com cápside helicoidal, ocorre antes da formação do RNA viral na célula.
A encapsidação do genoma viral ligada ao gasto de ATP ocorre para vírus com cápsides helicoidal
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Sobre os genoma virais em RNA e DNA: (escolha a opção correta)

Apenas os genomas em DNA apresentam cadeia duplas circulares
Apenas os genomas em RNA apresentam cadeias simples circulares
Apenas os genomas em DNA apresentam cadeia dupla
Apenas os genomas em RNA apresentam cadeias simples lineares

Sobre a classificação de Baltimore: (escolha a opção correta)

A classe III de Baltimore agrupa vírus com genoma dsRNA
A classe IV de Baltimore agrupa vírus com genoma dsDNA
A classe I de Baltimore agrupa vírus com genoma ssDNA
A classe II de Baltimore agrupa vírus com genoma ssRNA
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A sequência do genoma de uma população de vírus de RNA agrupa-se em torno de uma sequência “master”, mas cada genoma é diferente. Um genoma raro com uma mutação específica pode sobreviver a um evento de seleção e a mutação será encontrada em todos os genomas que descendem desse. Esta descrição corresponde a:

Template switching
Bottleneck
Quasispecies
Mutational coupling

Sobre a variabilidade genética dos genomas virais, escolha a opção correta

Os vírus em RNA apresentam menor variabilidade genética.
Os vírus, por serem pequenos, são conhecidos em profundidade e sabe-se a função de cada gene.
A maior variabilidade genética de um vírus tem na origem a atividade da enzima RNA polimerase.
A maior variabilidade genética de um vírus tem na origem a atividade da enzima DNA polimerase.
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Os vírus SV40, HPV e adenovírus (não envelopados) entram na célula pelos seguintes mecanismos:

Fusão com a membrana plasmática e orientação da partícula viral até à membrana nuclear, sendo o genoma entregue no núcleo.
Endocitose mediada por recetores, sendo o genoma posteriormente libertado no citoplasma.
Formação de poro na membrana plasmática, ficando os genomas retidos no citoplasma onde decorre a replicação viral.
Endocitose mediada por recetores e orientação da cápside viral até à membrana nuclear, sendo o genoma entregue no núcleo.

As glicoproteínas que se apresentam no envelope viral do HSV são adquiridas da seguinte forma:

Quando a cápside viral sofre budding na membrana interna nuclear.
Quando a cápside viral sofre budding na membrana plasmática
Quando a cápside viral é envolta por vesículas de Golgi.
Nenhuma das frases anteriores está correta
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Qual dos seguintes vírus codifica para uma DNA polimerase?

HPV
Adenovirus
HSV
SV40

Efeitos de infeções virais conhecidas desde:

Antiguidade Clássica
Idade Moderna
Renascimento
Idade Média
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Espécies virais conhecidas:

Pequeno número, atendendo à ubiquidade dos vírus
Número maior ao das espécies de plantas
Outra
Estão na sua maioria incluídas em géneros, famílias e ordens

Um vírus cuja cápside seja de arquitetura icosaédrica:

Apresenta geralmente envelope
Tem maior possibilidade de encapsidar variantes de genoma de tamanho maior do que um vírus de cápside helicoidal
Tem mais possibilidade de formar cápsides vazias do que um vírus de cápside helicoidal
É fortemente estabilizado pela presença de genoma no seu interior
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O conceito de vírus:

Foi estabelecido com o estudo de bacteriófagos
Foi estabelecido ao ser estudada a causa da poliomielite
É um resultado dos trabalhos de Pasteur sobre a raiva
Foi estabelecido ao estudar-se a causa da doença do mosaico do tabaco

De entre os vírus de RNA que infetam mamíferos:

Um pequeno número de espécies contém RNA e DNA como suporte de informação genética.
Existem muitas famílias cujo primeiro passo de expressão de informação genética é a transcrição
Pequenos números de famílias têm envelope.
Famílias que recorrem à transcrição reversa
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Interferão:

É produzido rapidamente após a infeção, e em quantidade muito elevadas
Tem por efeito inibir a expressão especifica de mRNA em células vizinhas de células infetadas
Tem por efeito inibir a expressão generalizada de mRNA em células vizinhas de células infetadas
Induzido mais eficientemente por vírus de DNA

O tamanho dos genomas virais de RNA é aproximadamente de:

Algumas centenas de aminoácidos
Uma dezena de milhar de bases
Várias dezenas de milhares de bases
Aproximadamente 10000 aa
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As ligações entre as unidades que compõem a cápside viral:

São catalisadas por enzimas de hospedeiros
Fortes e irreversíveis
São ligações reversíveis cuja estrutura depende fortemente das condições do meio
Podem ser internas para armazenar energia química

Os vírus cuja porta de entrada é o epitélio intestinal:

Não têm envelope
Arbovirus
DNA
Têm envelope
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As proteínas não estruturais estão codificadas:

Obrigatoriamente na extremidade 3’ do genoma na superfície – picorna vírus-like
Nenhuma
Nos genes dos hospedeiros nos vírus de DNA
Obrigatoriamente na extremidade 5’ do genoma na superfície – sindbis vírus-like

Os seguintes tipos de agrupamento existem na fase viral:

Espécie, família e ordem
Espécie, subfamília e classe
Género, família e ordem
Espécie, género e classe
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A lise::

Não impede a entrada de partículas por endocitose
Se ocorrer em infeção por vírus com envelope é num estádio tardio
É frequentemente no início da infeção produtiva do vírus com envelope
É rara em infeções por vírus sem envelope

. Os vírus de animais de genoma segmentado:

São frequentes entres os vírus cujo genoma é de DNA
São os que têm menos genoma
Apresentam geralmente os segmentos repartidos por várias partículas virais
Apresentam todos os fragmentos na mesma partícula viral
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Quais as principais diferenças entre um organismo viral e uma célula eucariótica:

Os vírus multiplicam-se por divisão de um antecessor, num processo semelhante à meiose
Alguns vírus sofrem processos de MPT
Os vírus não codificam os componentes necessários ao metabolismo energético
Os vírus são resultado de um processo de montagem dos seus componentes, que termina antes do final da fase de eclipse

As partículas virais têm dimensões de ordem:

Um décimo do tamanho das células hospedeiras
Dezenas e centenas de micrómetros
Dezenas e centenas de angströns
Dezenas e centenas de nanometros
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Classificação de Baltimore:

Pode vir a englobar os viroides se se considerar uma classe adicional de RNA
Existem 3 classes de vírus de RNA e 4 vírus de DNA
Abrange todos os vírus conhecidos
É importante o critério de distinção entre géneros da mesma família

Na replicação do genoma de um vírus de RNA de tamanho típico:

Cada genoma replicado apresentar aproximadamente 20 erros
Cada genoma replicado apresenta aproximadamente 1 erro
Há menos probabilidade de erros quando se usa uma DNA polimerase
Os ribossomas podem ultrapassar codões STOP para não originar erros
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Contagium Vivum Fluidum, significa:

Partículas constituídas por proteínas e ácidos nucleicos capazes de se multiplicar apenas em tecidos vivos.
Organismo com dimensões sub-microscópicas, capaz de se multiplicar em tecido vivo.
Organismo com dimensões de vários mícron, capaz de se multiplicar em bactérias.
Bacteriófago infeta a planta do tabaco.

Objetivo terapia de sy:

Combate de micoses
Combate de Poliomielite
Combate infeções virais latentes
Combate infeções bacterianas
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Considera-se organismo como vírus:

Formação a partir da divisão de uma partícula pré-existente
Constituído por moléculas autorreplicante RNA
Genoma DNA< 2 Mbp
Formação a partir de montagem de constituintes pré-formados

Hemaglutinação

Aglutinação de eritrócito á superfície de células
Aglutinação de eritrócitos à superfície de partículas virais que se quer quantificar.
Interação partícula viral com co-recetores de linfócitos B
Interação antigénio-anticorpo (ELISA)
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Métodos diagnóstico viral (deteção de ácidos nucleicos)

Baseiam-se em amplificação isotérmica
Baseiam-se na pesquisa de anticorpos contra vírus
Empregam sondas Taqman
Baseiam-se em PCR

Viroíde difere de RNA satélite porque:

RNA satélite codifica proteínas da cápside
Viroíde é encapsidado e RNAs não.
Virioide tem aproximadamente 300 bases e RNA aproximadamente 1000
Viroíde não codifica proteínas com RNA de cadeia simples.
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Vírus RNA sem Transcriptase reversa:

Têm pouco processo de montagem no núcleo
Quase todos têm processo de montagem no citoplasma
Quase todos replicam no citoplasma
Replicam genoma no citoplasma

Replicação genoma 10 Kb:

100 e 1000 erros de RNA
1 a 10 erros se for RNA
100 e 1000 erros se DNA sem transcriptase reversa
1 a 10 erros se for DNA sem atividade Transcriptase reversa
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Poliomielite causada por:

Por vezes por SV40
Vírus cuja porta de entrada é o intestino
Vírus DNA fica latente em neurónios
Polyoma vírus

Classe de Baltimore:

Genoma RNA de dupla cadeia (classe III), porque viroides têm genoma com auto emparelhamento
Em nenhum porque viroides não têm informação.
Genoma RNA negativo (Classe V), porque viroides não são traduzidos em proteínas após entrarem na célula
Genoma RNA transcritos em DNA (classe VI), porque virioides se integram no genoma hospedeira.
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Vírus RNA com atividade mensageira são:

Mais comuns em plantas que em vertebrados
Genoma < 5 Kb
Mais comuns em vertebrados que em plantas
Não tem envelope

Vírus DNA simples

Replicam-se no citoplasma
Vírus que dependem de infeção conjunta com adenovírus
Não têm envelope
Genomas > 8,5 Kb
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Cápside icosaédrica:

Formada por icosaedro
Todos vértices no mesmo plano
Pelo menos 1 eixo de simetria 5x
Todas faces triangulares

Cápside icosaédrica do vírus com genoma simples:

Encapsidem genoma após montagem
Requerem energia para encapsidar.
Montados sobre genoma já enovelado
Necessitam proteína Scafold para montagem
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Mecanismos especializados para uma dada sequência de RNA

Silenciamento pós-transcripcional (RNAi)
Supressão silenciamento
Apoptose
Degradação RNA pelo interferão

Métodos de diagnóstico viral real time PC, TH importante para especificidade:

Deteção dos produtos amplificados de fluorocromo de intercalação
Deteção de produtos amplificados basear em sondas de Taqman
Deteção de fluorescência efetuada T desnaturação.
Fluorescência começa a diminuir após alguns ciclos
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Budding:

Anti-recetores virais geralmente exportados da membrana da célula antes da saída partícula viral
Ocorrência prévia da lise celular
Anti-recetores virais expostos superiormente à célula não são detetados pelos anticorpos estão bloqueados pelos recetores
Local de saída das partículas virais não contêm anti-recetores

Vírus de classe IV não têm extremidade 5’ cap:

Ribossomas montados na região da estrutura secundária existe próximo da extremidade 5’
Primeiro... transcrição, extremidade 3’ do genoma
Ribossomas iniciam tradução na região intergénica
Ribossomas iniciam tradução pela cauda poli A
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Vírus transcritos sub-genómica, regulam principalmente proteínas necessárias à replicação de outras proteínas:

Supressão cadeia stop
Supressão cadeia iniciação
Slipicing alternativo
Clivagem poliproteína

Vírus recorrem à transcrição sub-genómica codificado na extremidade 5’ do genoma:

Sinais de poli-adenilação
Proteínas envolvidas na transcrição do genoma
Proteínas estruturais
Proteínas envolvidas na tradução do genoma
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Oncogénese viral:

Integração de oncogenes nas células do genoma viral
Infeção viral não origina descendência viável.
Infeção viral origina descendência viável
Integração determina genes virais no genoma do hospedeiro

Entre dois episódios agudos de herpes labial. P HSV-1 pode ser detetado:

Por ELISA (dirigido para as proteínas estruturais) nas mucosas da boca
Por PCR (dirigido para os genes das proteínas estruturais) nos nervos faciais
Por PCR (dirigido para os genes das proteínas estruturais) nas mucosas da boca
Por ELISA (dirigido para as proteínas estruturais) nos nervos faciais
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Os vírus com genoma de DNA de pequenas dimensões (ex.SV40)

Requerem que a infeção seja produtiva para poderem transformar estavelmente a célula hospedeira
Só infetam células que já tenham entrado na fase S
Só transformam células hospedeiras quando a infeção é abortiva
São capazes de originar uma transformação celular estável apenas quando integram a totalidade do seu genoma no hospedeiro

No caso do SV40

Uma função do antigénio T (large) impedir a fase S
Uma função do antigénio T (large) é induzir a passagem à fase G
Uma função do antigénio T (large) é funcionar como DNA polimerase
Uma função do antigénio T (large) é regular o balanço entre transcrição inicial (early) e transcrição tardia
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A estrutura das cápsides virais icosaédrica é geralmente estabilizada

Por ligações entre o genoma e a proteína da cápside
Por ligações fracas fortemente dependente das condições do meio
Pela existência de um envelope
Por ligações covalente. Estas, sendo fortes permitem que as partículas virais resistam em ambientes agressivos.

Na constituição de uma partícula viral pode encontrar

RNA polimerase no caso de ser um vírus de classe 4 (Baltimore) e DNA polimerase no caso de ser um vírus de classe 1 (Baltimore)
DNA polimerase no caso de ser um vírus de classe 2 (Baltimore)
DNA, RNA ou ambos, mas neste caso só tem funções genómicas
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No que respeita ao tamanho dos genomas

Podem-se encontrar vírus de RNA com mais de 80Kb
Podem-se encontrar vírus de DNA com menos de 5Kb
Podem-se encontrar vírus de RNA com menos de 1,5 Kb
Podem-se encontrar vírus de DNA com mais de 5 Mb

O interferão é um mecanismo de defesa celular

Adquirido (adaptativo)
Classificado como “cell autonomous”
Classificado como “cell non-autonomous”
Não inato
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Na resposta de um organismo contra uma infeção viral com que contacta pela primeira vez, a reação defensiva mais rápida envolve:

Inativação do P53
Silenciamento mediado por RNAi
Produção de anticorpos
Produção de interferão tipo 1

Relativamente ao processo de reconhecimento/entrada de viriões nas células, o péptido de fusão é um domínio:

De natureza hidrofóbica escondido no interior do antirecetor antes do reconhecimento
De natureza hidrofóbica presente à superfície do recetor
De natureza hidrofílica presente à superfície do antirecetor
De natureza hidrofílica escondido no interior do recetor antes do reconhecimento
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Relativamente aos vírus que se replicam no núcleo:

O processo de entrada no núcleo dá-se por fusão do envelope nuclear com o envelope viral
Têm todos genoma de DNA
Alguns têm genoma de RNA
Há sempre uma fase em que o genoma viral é integrado no genoma do hospedeiro

A estabilidade das cápsides de natureza helicoidal:

É assegurada por ligações fracas entre proteínas e genoma
É assegurada por ligações fracas entre proteínas
É assegurada por ligações covalentes entre proteínas e genoma
É assegurada por ligações covalentes entre proteínas
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O que há de comum entre a transformação celular estável mediada por SV40 e por um vírus do papiloma?

Bloqueamento de atividade de proteínas supressoras de tumor
Existência de uma infeção produtiva
Integração de genes estruturais no genoma do hospedeiro
Existência de uma infeção latente

Na infeção pelo SV40 de células do hospedeiro natural

É frequente ocorrer a transformação celular
A lise celular é causada pelo vírus
É na fase tardia que se deteta maior quantidade de antigénio T
A lise celular é causada pelas proteínas p53 e RB
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Na centrifugação em gradiente de densidade, quando é atingido o equilíbrio de densidade entre a partícula viral e o meio

A partícula aumenta a velocidade de descida.
A partícula volta a subir devido a sofrer maior impulsão hidrostática do que nas camadas superiores
A partícula para a descida e mantem a profundidade
a partícula passa a deslocar-se a velocidade constante até sedimentar no fundo do tubo.

Synsicium é um efeito citopático que consiste

Na lise das células infetadas
Na multiplicação das células infetadas
Na fusão das células infetadas
Na apoptose das células infetadas
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Considere uma preparação de um dado vírus com o título 1024 (preparação A) e outra (preparação B) do mesmo vírus com o título com o 256. Ambos os títulos foram obtidos num ensaio de hemaglutinação. Se em seguida fizer um ensaio de hemadsorção, é de esperar:

Não se pode prever o resultado
Que os valores dos títulos de A e B sejam semelhantes
Que A apresente um título superior a B no ensaio de hemadsorção
Que B apresente um título superior a A no ensaio de hemadsorção

O passo inicial do método ELISA numa modalidade concebida para detetar anticorpos contra um vírus é:

Nenhuma das opções anteriores está correta
Revestimento dos alvéolos com anticorpos específicos para o vírus
Revestimento dos alvéolos com uma molécula proteica de bloqueamento de adsorção
Revestimento dos alvéolos com a proteína da cápside (ou envelope) do vírus
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No silenciamento de RNA a enzima DICER

É responsável pela inativação dos RNA mensageiros
É especifica quando à sequência da molécula de RNA que é cortada
É responsável pelo corte das moléculas de RNA de cadeia dupla em siRNAs
Suprime o silenciamento

A maioria dos vírus de RNA que infeta vertebrados

Codifica proteínas que suprimem o silenciamento de RNA
Desencadeia processos de silenciamento que, contudo, não são uma resposta de defesa celular
Não desencadeia processos de silenciamento pois não têm genoma de ds-RNA
Não codifica proteínas supressoras de silenciamento
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Relativamente ao interferão do tipo I e o silenciamento de RNA

O interferão não é específico, mas o RNAi é específico contra o genoma que o desencadeia
Ambos são respostas defensivas especificas para o genoma que as desencadeia
Ambos são respostas defensivas não especificas para o genoma que as desencadeia
O interferão é específico, mas o RNAi não

A apoptose é

Um mecanismo de defesa não autónomo
Um mecanismo contra o qual os vírus não desenvolvem estratégias de contra-ataque
Um mecanismo de defesa adaptativo
Um mecanismo de defesa autónomo
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No caso de vírus que fundem o envelope com a membrana do endossoma

A exposição do domínio hidrofóbico do antirecetor não é dependente do abaixamento do pH do meio
A fusão é independente da exposição do domínio hidrofóbico
Nenhuma das anteriores está certa
A exposição do domínio hidrofóbico do antirecetor é dependente do abaixamento do pH do meio

No processo de saída por “budding”

É necessário que a célula se mantenha viva até ocorrer a saída
A exportação de proteínas virais para a membrana celular é bloqueada
Ocorre a lise celular antes da saída
Há uma desorganização total do sistema de membranas celulares antecedendo a saída
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O processo de estabelecimento de infeção pelo vírus do papiloma envolve:

Infeção de células das camadas superficiais da pele
Infeção de células em processo avançado de queratinização
Nenhuma das anteriores está correta.
Infeção das células das camadas profundas da pele

A cápside de natureza helicoidal:

É assegurada por ligações fracas entre proteínas e genoma
Forma-se por ligações covalentes entre proteínas e genoma
Tem origem numa procapside que se forma na célula que é preenchida pelo genoma viral
É assegurada por ligações fracas entre proteínas
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Na quantificação de partículas virais podemos considerar o seguinte:

Que o ovo embrionário é o hospedeiro indicado para análises de influenza vírus
Que o ovo embrionário é o hospedeiro indicado para a análise de herpes vírus
Que o processo de hemadsorção usando células de macaco é o indicado para a análise de herpes vírus por serem células alvo deste vírus (SV40)
Que a quantificação por microscopia eletrónica é a mais correta na determinação do número de partículas infecciosas

A cápside viral icosaédrica

Está geralmente coberta por glicoproteínas à sua superfície Tem ligações entre o genoma e a proteína da cápside (helicoidal)
Um vírus com este tipo de cobertura (apenas a cápside) pode entrar na célula hospedeira por fusão com membrana plasmática
Apresenta ligações covalentes entre capsómeros porque, sendo ligações fortes, permitem que as partículas virais resistam em ambientes agressivos.
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As cápsides icosaédricas de vírus com grandes genomas são:

Icosaedros cujas faces estão subdivididas em faces mais pequenas
Pequenas proteínas estruturais associadas a lípidos
Pequenas proteínas estruturais com características hidrofóbicas
Constituídos por proteínas estruturais de grandes dimensões

Numa célula que tenha recebido o interferão tipo 1 e que tenha expressado PKR e 2,5’ oligo A sintase,o bloqueamento da expressão é desencadeado por: (induzir: RNA cadeia dupla)

MHC (major jistocompatibility complex)
Proteínas virais
DNA de cadeia dupla
RNA de cadeia dupla
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A maior parte dos genomas de RNA tem dimensões:

Entre 10kb e 30kb
Inferior a 3kb
Entre 3kb e 10kb
Maior que 30kb

No caso de vírus que fundem o envelope com a membrana celular:

A exposição do domínio hidrofóbico do antirecetor não é dependente do abaixamento do pH do meio
A exposição do domínio hidrofóbico do antirecetor é dependente do abaixamento do pH do meio (fusão no endossoma)
A fusão é independente da exposição do domínio hidrofóbico
Nenhuma das anteriores está correta
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Os viroides:

São moléculas de DNA com elevado grau de auto-emparelhamento
São moléculas de RNA circular encapsidadas na cápsula do vírus helper (são não encapsidados)
São moléculas de RNA com elevado grau de auto-emparelhamento
Necessitam de um vírus helper para se replicarem (satélite)

A curva de crescimento de uma população de vírus numa cultura de células infetadas é na fase inicial de crescimento:

Uma curva em escada
Uma curva decrescente
Uma curva exponencial (bactérias)
Uma curva crescente em linha reta
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Em microscopia (ótica, eletrónica..) o poder de resolução é tanto maior quanto maior:

A frequência da radiação
O tamanho do especimen a observar
O tamanho das partículas que constituem a radiação
O comprimento de onda da radiação

Vírus que infetam vertebrados e que têm genoma de RNA, as classes de Baltimore que estão representadas com maior número de famílias são:

Classe 3
Classe 4 ou classe 5
Classe 6
Nenhuma das anteriores está correta
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Entre as várias teorias que pretendem explicar a origem de vírus e viroides:

A mais provável é que estes organismos sejam entidades independentes que evoluíram paralelamente aos organismos celulares a partir de moléculas pré-bióticas autorreplicantes (dependentes)
A mais provável é a de que estes organismos sejam formas de vida degeneradas que tenham evoluído regressivamente a partir de células
O mais provável é estes organismos terem origem extraterrestre
Não existe uma teoria única que possa explicar a origem destes organismos

Os vírus são organismo muito diversos. O número de espécies virais descritas é:

Nenhuma das anteriores está correta
Menor que o número de famílias descritas
Maior que o número de espécies de insetos que estão descritas
Surpreendentemente pequeno
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Nos genomas de RNA a recombinação dá-se, através de mecanismos que envolvem:

Corte e ligação de fragmentos (DNA)
A tradução do RNA em proteína
A transcrição do RNA em RNA ou DNA
A ocorrência de elevado número de erros consecutivos da enzima que transcreve o RNA

91. Numa célula infetada, o período de eclipse corresponde ao período que medeia entre a entrada do vírus na célula hospedeira e:

A lise celular
A produção das primeiras partículas virais dentro da célula Os primeiros sinais de replicação do genoma viral
A libertação de partículas virais infeciosas para o exterior da célula
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O vírus do papiloma:

Pode ficar integrado no genoma da célula hospedeira, mas essa situação só ocorre nos casos de infeções ligeiras, não associadas a tumores (graves)
Pode estar presente no citoplasma da célula hospedeira como um epissoma
Pode estar presente no núcleo da célula hospedeira como um epissoma
Está associado à formação de tumores quando todo o genoma viral fica integrado na célula hospedeira (não é todo o genoma)

As cápsides virais de um vírus sem envelope:

Formam-se sempre no citoplasma da célula hospedeira (capside- nucleo, proteinas estruturais-citoplasma)
São sempre revestidas por glicoproteínas
São estruturas muito estáveis e resistentes
Desagregam-se assim que o vírus entra na célula hospedeira
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Na quantificação de proteínas virais, podemos considerar o seguinte:

Que a quantificação por microscopia eletrónica é a mais correta na determinação do no de partículas que são infeciosas
Que o “vírus do mosaico do tabaco” pode ser avaliada pelo uso de ovos embrionados
Que para se quantificar o vírus SV40, tem de se proceder à técnica RT-PCR (transcritase reversa-PCR)
Que os ensaios de placas (plaque assay) são os mais corretos na determinação do no de partículas infeciosas

O que há de comum entre o SV40 e o vírus do papiloma?

São ambos vírus em ssDNA (DNA de cadeia simples)
Ambos induzem uma infeção produtiva (formação de partículas virais) na célula permissiva que infetam
Em ambos ocorre integração de todo o genoma na célula hospedeira
Ambos têm o ser humano como único hospedeiro
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A vantagem do real-time PCR por comparação ao PCR, na deteção de vírus em RNA, é a seguinte:

No real-time PCR a amplificação do gene é detetada por um software, em tempo real
No PCR a amplificação do gene é detetada por um software, em tempo real
No real-time PCR a amplificação do gene é detetada com recurso à eletroforese e gel de agarose
No PCR a amplificação do gene é detetada com recurso ao SYBR Green

A reação de real-time PCR é uma reação de amplificação em que:

O SYBR Green é amplificado em conjunto com a molécula de DNA
O SYBR Green é uma molécula que fica adicionada à extremidade da molécula de DNA amplificada
O SYBR Green é uma molécula que se intercala na molécula de DNA amplificada
O SYBR Green é usado em conjunto com a sonda TaqMan
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Nos genomas virais de RNA a recombinação dá-se através de mecanismos que envolvem:

A DNA polimerase
O mecanismo de copy.choice
A reação de transcrição do RNA em DNA
A reação de tradução do RNA em proteína

No processo de imunocaptura / RT-PCR

É uma técnica que faz uso da sonada TaqMan
Primeiro realiza-se o PCR e de seguida a imunocaptura
É um técnica que faz uso da transcritase reversa,por isso está direcionada para detetar genomas em DNA
A imunocaptura e o PCR são realizados num mesmo tubo
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Sobre as técnicas de deteção viral que aplicou nas aulas práticas

a técnica ELISA-DAS faz uso de dois anticorpos de captura
o Teste ELISA é mais sensível que a amplificação por RT-PCR
A técnica do RT-PCR amplifica todo o genoma viral
O anticorpo conjugado com a fosfatase alcalina ligou-se diretamente ao antigenio

A latência do herpes ocorre:

Neurónios sensoriais
À volta da boca
Faringe
SNC
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Syncitium tem efeito citopático:

Componente celular ocorresincronização montagem cápside replicação genoma
Componente celular ocorre acumulação partículas virais antes da lise
.Lise celular resultante da fusão das células adjacentes
Lise celular

Os herpes vírus,

Estabelecem sempre uma fase de latência no hospedeiro
São frequentemente eliminados na totalidadedo organismo hospedeiro
Estabelecem infeções produtivas nos nervos faciais
No cado de serem neurotrópicos estabelecem infeções latentes nas mucosas da boca.
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O genoma dos herpes vírus é, no que respeita à classificação de Baltimore:

Classe 7
Classe 3
Classe 2
Classe 1

Os herpes vírus codificam:

A maior parte das proteínas necessárias à replicação do genoma
Apenas um reduzido número de proteínas necessárias à replicação do genoma
Cerca de 1200 genes essenciais e auxiliares
Um elevado número de intrões
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Qual das seguintes características

Poder ser utilizado para infetar células do sistema nervoso central
Persiste durante longos períodos na célula alvo, como epissoma
Poder acomodar cassetes de expressão bastante maiores em comparação com vetoresbaseados em parvo e retrovírus
Persiste durante longos períodos na célula alvo, integrando-se no genoma do hospedeiro

Os adenovírus

Têm envelope
Replicam-se no citoplasma
Replicam-se no citoplasma
Só se replicam em células que estejam em fase S
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Algumas das proteínas codificadas pelos adenovírus interagem com proteínas supressoras detumores [P53 e Rb]. Essas proteínas (dos adenovírus), estão codificadas no gene:

E1
E3
E2
E4

Os VA RNAs são transcritos em elevado número no inícioda infeção pelos adenovírus. A sua função é:

Bloquear a ação dos ribossomas por interferirem com o lef2
Servir de núcleo de condensação para as proteínas da cápside
Preparar a lise celular
Bloquear a ação do interferão e do silenciamento pós-transcricional
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Os vetores virais baseados em adenovírus,

.Permitem a expressão do transgene durante um período de meses
Têm uma capacidade da carga (tamanho do transgene) muito pequena
Permitem a expressão do transgene durante um período de dias a semanas
Originam a lise das células alvo após a expressãodo transgene

Num vetor adenoviral de 3a geração

O DNA de enchimento é utilizado para prevenir recombinação com genes das célula fábrica
O tamanho do DNA de enchimento (stuffer DNA) corresponde a cerca de 200% do genomawild-type (75-105%)
O genoma é apenas composto pelos ITR, sinal de empacotamento, gene E1 e gene de interesse
A capacidade de replicação nas células alvo é muito superior à dos de 1o geração
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Um dos efeitos secundários de terapia génica usando um vetor baseado em adenovírus é:

Infeção viral das vias respiratórias
Transmissão de SV40
Ativação do sistema imunitário do hospedeiro
Ativação de oncogenes celulares por efeito de integração do gene de interesse próximo de um oncogene celular

Nidovirales, é a designação de um agrupamento taxonómico ao nível de:

Classe
Divisão
Familia
Ordem
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O agrupamento mais abrangente que existe na taxonomia viral é:

Divisão
Familia
Genero
Ordem

De entre os virus das classes III, IV, V e VI

o virus da classe VI são um alvo fácil do silenciamento mediado por RNA por exporem o dsRNA no citoplasma b) o virus da classe III são um alvo fácil do silenciamento mediado por RNA por exporem o dsRNA no citoplasma c) os virus da classe V são os únicos que ativam o silenciamento mediado por RNA d) nenhuma das classes de virus é substancialmente afetado pelo silenciamente mediado por RNA RESPOSTA ABERTA 1. Num ensaio de contagem de placas de lise, contou-se uma média de 220 placas na diluição 10-6. O volume usado no plaqueamento foi 0.5 ml. Qual é o título da preparação em pfu/ml? (indique os cálculos) 220*2*10^6 2. Em termos histórias, em que altura começou a vacinação? A varíola (endémica da China em 100ac) levou ao desenvolvimento da variolização. Em 1796 Edward Jenner, na Europa (Inglaterra), utilizou material retirado de pústulas de varíola bovina para inocular um rapaz. Nascendo a vacinação (“vacca”), mesmo antes de se conhecer o conceito de vírus. 3)Qual o título viral de uma cultura em que foram contabilizadas 15 placas fágicas após espalhamento de 0,1mL da diluição 10 -6 na caixa de petri? E se tivesse espalhado 0,5mL, qual seria o título viral? 0,1mL ---- 15pfu 0,5mL ---- 15pfu 1mL ------- x 1mL ----- y x = 150pfu/mL 150x10 6=1,5x10 8pfu/mL y = 30pfu/mL 30x10 6=3x10 7pfu 4)Refira dois aspetos que obrigam a que a transcrição do genoma infecioso ocorra no núcleo. Splicing e roubar os CAPs 5)Vários vírus tem a possibilidade de ultrapassar codões STOP durante a tradução. De um modo geral, com que objetivo. Para conseguir obter proteínas que não são necessárias em quantidade elevada
os virus da classe V são os únicos que ativam o silenciamento mediado por RNA
o virus da classe III são um alvo fácil do silenciamento mediado por RNA por exporem o dsRNA no citoplasma
nenhuma das classes de virus é substancialmente afetado pelo silenciamente mediado por RNA
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