Quando criança, ele possui uma mentalidade e personalidade medianas, como um jovem poderia ter, mas mostrou inteligência e a capacidade de ler uma situação, como mostrado quando ele pulou repetidamente no local para ouvir o tilintar de suas moedas restantes conforme as instruções (ou mais como intimidado de fazer) por um trio de delinquentes de outra escola, e se não fosse pela intervenção de um certo garoto loiro , ele provavelmente teria doado o resto de suas moedas em troca de ser deixado sozinho, ou simplesmente porque não queria se machucar.
Já adulto, Naoto é um indivíduo justo que também está determinado a salvar sua irmã. Ele tem uma personalidade séria e geralmente não se diverte com os avanços humorísticos dos outros, especialmente de Takemichi . Ele também está disposto a abraçar possibilidades absurdas, como o fato de Takemichi poder saltar no tempo, e até mesmo fazer suas próprias hipóteses sobre isso.
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Além disso, ele também não questiona Takemichi toda vez que ele vai ao apartamento deles para apertar as mãos, atendendo silenciosamente aos pedidos particularmente estranhos de aperto de mão da loira, e apenas comentou uma vez sobre isso, pode ficar implícito que ele nunca investigou mais sobre isso.